Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 BPTF-203ENST00000335221 2627 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AL355916.1-202ENST00000508827 5103 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 ILDR2-201ENST00000271417 13140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 RNF145-209ENST00000520638 2340 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms