Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 IL20-203ENST00000391930 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AC027541.1-201ENST00000519306 485 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 SATB1-AS1-242ENST00000627496 807 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 BX664727.3-202ENST00000421686 1761 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 FBP2P1-202ENST00000424473 530 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGA3P26006 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms