Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 R3HDM2P1-201ENST00000505381 1960 ntBASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 NFASC-204ENST00000401399 10205 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC000099.1-202ENST00000413812 1912 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 UBXN8-201ENST00000265616 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 TMSB15B-208ENST00000620307 2286 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 CPM-211ENST00000551568 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 BTBD3-202ENST00000378226 4904 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 RNF139-AS1-201ENST00000499418 5654 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 C10orf25-201ENST00000625168 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 SH3GLB1-205ENST00000616170 6456 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 GPR63-201ENST00000229955 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 NTRK3-201ENST00000317501 3826 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 OR2M4-202ENST00000641868 5934 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 SCN11A-201ENST00000302328 6500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 CMKLR1-202ENST00000412676 5110 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 TRPM3-214ENST00000396292 4740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 CD28-201ENST00000324106 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 ITGB6-201ENST00000283249 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 CBLN2-203ENST00000581073 537 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
POLR2AP24928 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165 ms