Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MYOM1-202ENST00000356443 5847 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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COL4A6Q14031 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 FMN2-206ENST00000543681 2902 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 DCLK1-202ENST00000360631 8007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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COL4A6Q14031 OXCT1-204ENST00000509987 1441 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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COL4A6Q14031 TRPM3-214ENST00000396292 4740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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COL4A6Q14031 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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COL4A6Q14031 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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COL4A6Q14031 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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COL4A6Q14031 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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COL4A6Q14031 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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COL4A6Q14031 FAM13A-202ENST00000395002 4945 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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COL4A6Q14031 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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