Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CD247P20963 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CD247P20963 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CD247P20963 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CD247P20963 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CD247P20963 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
CD247P20963 AC073324.1-201ENST00000425993 1435 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
CD247P20963 TRIM49-202ENST00000532501 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
CD247P20963 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 PSG5-201ENST00000342951 1626 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 PLCE1-AS2-202ENST00000432782 1612 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 NGDN-201ENST00000397154 2204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 EEF1AKMT1-202ENST00000382758 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 TRAJ24-201ENST00000390513 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AC104455.1-201ENST00000417340 736 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AL450384.2-201ENST00000425669 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 RPL12P19-201ENST00000429825 486 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AL035420.1-201ENST00000430679 458 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AL513303.1-201ENST00000432452 591 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 RPL37A-204ENST00000441179 529 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 PSMA2-204ENST00000445517 683 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AL389885.1-201ENST00000447227 384 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 TUBB8P1-201ENST00000447235 727 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 OR7H1P-201ENST00000448965 922 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 GAPDHP28-201ENST00000455134 1003 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AC117382.1-201ENST00000468074 730 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 MRPS28-207ENST00000521434 585 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 RPL10P19-203ENST00000522289 663 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 PTK2-241ENST00000522950 548 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 TBX5-AS1-203ENST00000531202 822 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AC090092.1-202ENST00000533591 685 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 LINC02137-201ENST00000561906 644 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 THSD4-AS1-204ENST00000566268 468 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 TEX51-207ENST00000568484 731 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AL161725.1-210ENST00000590240 1224 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AC068631.1-229ENST00000599314 739 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 MIR4435-2HG-217ENST00000604981 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AC010680.5-201ENST00000605021 463 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AC019322.2-201ENST00000605634 147 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 SMIM11B-201ENST00000612624 1021 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 SLC20A1P2-201ENST00000618036 966 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 ZC3H14-203ENST00000318308 1384 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CD247P20963 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms