Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 NOX4-203ENST00000375979 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 GAPDHP55-201ENST00000423136 803 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 LINC02243-201ENST00000441841 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC008629.1-201ENST00000506486 812 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AL354733.2-202ENST00000615485 742 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 OR2G6-201ENST00000343414 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AL596451.1-201ENST00000419824 572 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 HCG20-208ENST00000439406 1202 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AL034376.2-201ENST00000568110 573 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 FGL2-202ENST00000637771 989 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 OR5AU1-204ENST00000641822 1197 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 TAAR2-202ENST00000367931 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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