Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 PPHLN1-202ENST00000317560 1359 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 LPAR1-205ENST00000541779 2490 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL353795.1-201ENST00000439134 1775 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CPM-202ENST00000546373 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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E2F1Q01094 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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E2F1Q01094 AP000534.1-201ENST00000444162 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC092570.2-201ENST00000452117 1143 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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E2F1Q01094 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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E2F1Q01094 AC015871.4-201ENST00000624650 2260 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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E2F1Q01094 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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E2F1Q01094 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
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