Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 AC097717.1-225ENST00000600829 709 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 POLR3A-201ENST00000372371 6640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ZNF441-201ENST00000357901 4356 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 WDR31-202ENST00000374193 4878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ZNF10-201ENST00000248211 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ERG-204ENST00000398907 4809 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ADCY10P1-203ENST00000567255 4569 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 HSP90AB7P-201ENST00000450068 2454 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 LY75-CD302-202ENST00000505052 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 CPEB1-209ENST00000614918 4882 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 CNPY1-202ENST00000406197 560 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 LINC01173-201ENST00000629370 331 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 PTPRR-203ENST00000378778 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 PDZK1-202ENST00000417171 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ZNF197-205ENST00000396058 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ARHGEF7-203ENST00000375723 4957 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ANKRD42-202ENST00000393389 4066 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 SLMAP-203ENST00000383718 6749 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 SLC16A12-201ENST00000371790 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 CALML4-208ENST00000540479 4603 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 KIF6-208ENST00000538893 2386 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 COQ10B-202ENST00000409010 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 OR1D2-203ENST00000641833 4887 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 SNORA68-201ENST00000384437 133 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 AOX2P-204ENST00000487742 3284 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 NMD3-201ENST00000351193 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 FGFR2-206ENST00000358487 4255 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 5570 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 SELENOT-202ENST00000471696 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms