Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AC087855.2-201ENST00000518217 537 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AC015911.3-201ENST00000592908 849 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 FMOD-201ENST00000354955 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 MAN1A2-201ENST00000356554 8576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 VLDLR-AS1-201ENST00000416826 3167 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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PTPRMP28827 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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PTPRMP28827 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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PTPRMP28827 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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PTPRMP28827 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ZCCHC11-204ENST00000371544 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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PTPRMP28827 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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PTPRMP28827 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ZNF592-201ENST00000299927 7863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 PCDH15-233ENST00000621708 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 GPR156-201ENST00000315843 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ZNF300-202ENST00000394226 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ZNF469-202ENST00000565624 13279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PTPRMP28827 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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