Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC01331-201ENST00000507781 568 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RPL10P19-201ENST00000519013 301 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL118558.1-201ENST00000557551 566 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 TP53TG3HP-201ENST00000563487 346 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC090774.3-201ENST00000578666 742 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ZNF257-207ENST00000600162 817 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL158151.4-201ENST00000600965 507 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 EDRF1-AS1-205ENST00000601363 712 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL021808.1-201ENST00000604325 1117 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 PRYP3-202ENST00000607210 444 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 SMIM11B-201ENST00000612624 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 PDZK1P1-203ENST00000616036 577 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 CTSLP2-202ENST00000626319 1104 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC135731.2-201ENST00000603029 2098 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 CLCN3P1-202ENST00000609203 1944 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ANKS1B-215ENST00000549493 3328 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 CCR6-203ENST00000400926 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 METTL2A-204ENST00000616852 3150 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 PALM2-AKAP2-201ENST00000302798 4718 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RBMS2-204ENST00000550726 1452 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 UTP23-201ENST00000309822 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 HSP90AB2P-201ENST00000507090 2176 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 DCAF4-212ENST00000553457 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL157895.1-201ENST00000451713 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC010533.1-201ENST00000624875 2105 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL513523.1-201ENST00000417868 1309 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 NELL2-202ENST00000395487 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 FCAR-205ENST00000391723 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC234778.1-201ENST00000399253 370 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL358452.1-201ENST00000414995 800 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL607028.1-201ENST00000433455 794 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC004006.1-201ENST00000434994 377 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC02093-201ENST00000440522 485 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ELOBP1-201ENST00000447693 357 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC104164.4-201ENST00000483456 493 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL630P-201ENST00000483714 297 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC008667.3-201ENST00000506892 553 ntTSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC106774.1-201ENST00000515105 321 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AP003499.1-201ENST00000527217 574 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC025252.2-201ENST00000537470 502 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 TMEM132D-AS1-206ENST00000541320 440 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC024257.1-201ENST00000547523 566 ntTSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 OR7E159P-201ENST00000553761 298 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL162171.2-201ENST00000555444 905 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC120498.4-201ENST00000561649 320 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC012186.1-201ENST00000566702 398 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL118P-201ENST00000580570 302 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL49P-201ENST00000581392 298 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 MIR6751-201ENST00000610479 63 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms