Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 LRRC37BP1-203ENST00000417404 4742 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 PPHLN1-202ENST00000317560 1359 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 VPS8-207ENST00000436792 5011 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 PTPDC1-204ENST00000620992 4437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 DDX10-203ENST00000526794 6707 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 CXCR4-201ENST00000241393 1682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AC245505.2-201ENST00000553572 3055 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PTPRMP28827 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PTPRMP28827 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PTPRMP28827 DDHD1-210ENST00000612692 12339 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PTPRMP28827 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PTPRMP28827 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PTPRMP28827 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PTPRMP28827 AC022400.3-201ENST00000399449 3810 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 ANKFN1-202ENST00000566473 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 SH3YL1-202ENST00000402632 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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