Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 STARD13-AS-224ENST00000608496 787 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC241377.2-202ENST00000636462 997 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 CCNT1-206ENST00000640148 596 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 OR7E91P-201ENST00000400027 866 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC015987.1-201ENST00000419211 804 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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SCN2BO60939 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 B4GALT4-209ENST00000471675 712 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC110760.2-202ENST00000507517 946 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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SCN2BO60939 AC091178.1-204ENST00000577328 366 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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SCN2BO60939 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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SCN2BO60939 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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SCN2BO60939 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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SCN2BO60939 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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SCN2BO60939 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 CAGE1-208ENST00000512086 2537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 OSGEPL1-204ENST00000519810 2216 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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