Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 SART3-201ENST00000228284 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 BMX-202ENST00000348343 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC002464.1-201ENST00000569685 1530 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AKAP12-202ENST00000354675 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 GOLGA6D-202ENST00000618219 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 FTSJ3-201ENST00000427159 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC040162.3-201ENST00000572067 3907 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 TTC39B-206ENST00000507285 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AL445235.1-201ENST00000431202 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC023824.7-201ENST00000623041 5731 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 NCOA4-207ENST00000585132 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 OR7E24-201ENST00000456448 1550 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 MTHFD2-203ENST00000409804 1757 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 RNF38-206ENST00000377885 4985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC138951.1-201ENST00000502532 2685 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC124017.1-202ENST00000506950 1616 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 SEZ6L-205ENST00000403121 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 ZNF250-201ENST00000292579 6364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AL365226.2-201ENST00000418403 397 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 TRIM26BP-206ENST00000427723 753 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC092568.1-201ENST00000440950 1284 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AL353072.1-201ENST00000446021 442 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 FP325330.1-201ENST00000457518 372 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 RN7SL420P-201ENST00000463843 298 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 PTPRE-207ENST00000471218 522 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 LINCR-0001-201ENST00000517732 562 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 OR7E8P-201ENST00000532847 1000 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 PGA4-202ENST00000537932 840 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 PGA3-204ENST00000538258 867 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AP000619.1-201ENST00000540293 1000 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 PGA3-207ENST00000543125 968 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 PGA4-206ENST00000544899 867 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC004828.1-201ENST00000555303 654 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 LCMT1-AS1-202ENST00000563962 766 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC073878.1-201ENST00000567503 474 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AL109614.1-201ENST00000620327 419 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 PNMA8A-202ENST00000438932 3335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 DSG1-201ENST00000257192 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 ATXN1L-201ENST00000427980 7886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 HNRNPA1L2-201ENST00000357495 3011 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 CRX-207ENST00000613299 4193 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 CSNK1G1-211ENST00000635142 5548 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AL133355.1-201ENST00000568017 2388 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 FBXL2-222ENST00000538892 2793 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 MRPS33-201ENST00000324787 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 TRO-208ENST00000420798 3613 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 CDYL-201ENST00000328908 3419 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC023790.2-201ENST00000543321 2403 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 FNBP1L-201ENST00000260506 5341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 SLC24A1-201ENST00000261892 5768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 LMO7-201ENST00000321797 5647 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 C8orf44-SGK3-201ENST00000519289 2949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AP004147.1-201ENST00000505153 6314 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 C2orf80-201ENST00000341287 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AL390760.1-201ENST00000366188 410 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 ACBD5-204ENST00000375905 3848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 CBWD1-207ENST00000382447 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 NEK10-203ENST00000383770 1257 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 KRTAP9-1-201ENST00000398470 753 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 RPSAP63-201ENST00000412013 888 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AL109810.1-201ENST00000435008 495 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AC093655.1-201ENST00000446187 641 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 POLR2CP1-201ENST00000453699 765 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FBXO3Q9UK99 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms