Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 LINC01482-201ENST00000585484 2616 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 TIMM21-204ENST00000580087 2524 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CASP4-201ENST00000393150 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 EIF4ENIF1-201ENST00000330125 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 MAP3K7CL-201ENST00000286791 1725 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LIPF-202ENST00000355843 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LL22NC03-63E9.3-201ENST00000407120 3111 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ZNF780A-202ENST00000414720 2396 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC104447.1-201ENST00000624214 2124 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 RSRC2-201ENST00000331738 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CCR3-208ENST00000545097 1786 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 RIT2-201ENST00000326695 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ATF3-204ENST00000366983 858 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CBWD1-207ENST00000382447 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 MAML3-201ENST00000398940 831 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 AL080285.1-201ENST00000404225 984 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CNPY1-202ENST00000406197 560 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 VN1R13P-201ENST00000406212 885 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 TAS2R2P-201ENST00000421146 910 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC012594.1-235ENST00000424391 727 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL356387.1-201ENST00000426321 476 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 TTC28-AS1-216ENST00000437713 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 GCNT1P5-201ENST00000449274 682 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 AL449212.1-201ENST00000499853 517 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 SELENOP-204ENST00000507920 786 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CASC16-201ENST00000510238 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 LINC01170-201ENST00000519703 406 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 AP006296.1-201ENST00000537438 499 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 PSMA6-202ENST00000540871 912 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 PRR13-207ENST00000549581 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 ZNF85-206ENST00000596476 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ZCCHC17-209ENST00000627541 1158 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC012594.1-254ENST00000628002 438 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC01206-228ENST00000628718 871 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CLEC19A-205ENST00000636231 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 PPP3R2-202ENST00000636434 1081 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 WDR31-203ENST00000374195 3101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 XRCC6P2-201ENST00000457831 1822 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LDB3-201ENST00000263066 3873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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