Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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COL4A6Q14031 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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COL4A6Q14031 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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COL4A6Q14031 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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