Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
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SNX13Q9Y5W8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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SNX13Q9Y5W8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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SNX13Q9Y5W8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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SNX13Q9Y5W8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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SNX13Q9Y5W8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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