Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms