Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD2APQ9Y5K6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD2APQ9Y5K6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD2APQ9Y5K6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD2APQ9Y5K6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD2APQ9Y5K6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD2APQ9Y5K6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD2APQ9Y5K6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD2APQ9Y5K6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD2APQ9Y5K6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD2APQ9Y5K6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD2APQ9Y5K6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD2APQ9Y5K6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD2APQ9Y5K6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD2APQ9Y5K6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD2APQ9Y5K6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD2APQ9Y5K6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD2APQ9Y5K6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms