Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDGFL3Q9Y3E1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms