Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms