Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms