Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms