Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PARP4Q9UKK3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms