Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX41Q9UJV9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms