Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL4Q9UJQ4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms