Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms