Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms