Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK4Q9UBT3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DKK4Q9UBT3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms