Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEMTQ9UBM1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEMTQ9UBM1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms