Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD7Q9P2D1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD7Q9P2D1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms