Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms