Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms