Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms