Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms