Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE4

CCDC87, Coiled-coil domain-containing protein 87, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC87Q9NVE4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC87Q9NVE4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC87Q9NVE4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms