Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms