Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU23

LYRM2, LYR motif-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM2Q9NU23 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYRM2Q9NU23 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms