Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms