Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms