Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms