Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms