Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC17Q9NP64 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms