Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms