Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK5

AGO4, Protein argonaute-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGO4Q9HCK5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGO4Q9HCK5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGO4Q9HCK5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGO4Q9HCK5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGO4Q9HCK5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGO4Q9HCK5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGO4Q9HCK5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGO4Q9HCK5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGO4Q9HCK5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGO4Q9HCK5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGO4Q9HCK5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms