Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 MCEE-201ENST00000244217 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP3Q9H4L4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms