Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms