Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIL1Q9H173 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIL1Q9H173 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms