Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC22A4Q9H015 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC22A4Q9H015 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms