Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms