Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms